1.过敏性休克：1例因双肺感染患者静滴甲硝唑注射液后约10分钟，突感手痒，继而出现胸闷、气短、寒战，继之烦躁，表情淡漠。体温37.3℃，血压60/40毫米汞柱，脉搏130次/分钟，双肺呼吸音粗。立即停止输液，给予肾上腺素、异丙嗪、地塞米松等抢救，5分钟后病情好转。甲硝唑引起的过敏性休克实属罕见，希引起注意。
2.哮喘样发作：1例行右乳癌根治术患者，术后用甲硝唑注射液静滴。第2日输完后患者出现呼吸困难，心跳加快，端坐呼吸，喘息咳嗽，咳痰。给予解痉、镇静药物治疗症状缓解。第3日当再次输入甲硝唑70毫升时，再次出现前日症状，停药用同样方法治疗后症状缓解。
3.急性肺水肿死亡：1例患急性乳腺炎的患者给予甲硝唑注射液250毫升静滴，每分钟100滴，用药10分钟时患者自述头痛、头晕伴恶心，呕吐胃内容物1次。服1片去痛片后症状未缓解，未经其他处理，继续滴入甲硝唑，约30分钟后滴完。输液完毕后，患者即感胸闷，呼吸困难，咳嗽，吐出大量粉红色泡沫样痰，躁动不安，口唇紫绀；双肺布满干湿啰音，心率每分钟105次，心律规整无杂音。立即进行抢救，吸氧，静脉注射氟美松、氨茶碱、速尿等药物，效果欠佳，出现不规则呼吸至呼吸停止，心脏停止跳动。抢救无效死亡。本例死亡与输液速度过快有关。
4.严重龟头溃烂：1例牙周炎患者口服甲硝唑和牙周宁治疗。首次服用约1小时自感口唇麻木，全身不适，随即龟头发痒、水肿，8小时后龟头出现溃烂，疼痛难忍。立即停药，采用抗过敏等治疗3天后痒痛症状消失，1周后龟头皮肤脱屑痊愈。为探明上述症状为何药所致，在严密观察下先服用牙周宁40毫克/次，观察4小时未发现任何不适；第2天又服用甲硝唑0.1克，大约45分钟患者自感口唇发麻，全身不适，即用抗过敏药，3小时后症状消失。以后又继续服用牙周宁，未出现任何不适感。
5.毛舌：口服甲硝唑片0.2克，每天3次，连服5天。结果20%患者出现毛舌（是舌背人字沟前方丝状乳头过度生长和延缓脱落形成的毛发状损害，可呈黑、褐、白、黄、绿等多种颜色，被分别称为黑毛舌、白毛舌、黄毛舌、绿毛舌等），多分布在舌背正中部及舌背尖部。停药后，5～10天内消失3例。
6.泌尿道不良反应：19例厌氧菌感染者给予甲硝唑静滴或口服，用药后3～5天出现排尿困难或尿潴留，认为是甲硝唑引起的反应性膀胱炎。对排尿困难者给予热敷膀胱区，尿潴留者给予无菌导尿。停用甲硝唑并采取相关治疗，5～9天恢复正常。
7.白细胞、血小板减少：1例患者在静滴甲硝唑注射液期间发生白细胞、血小板减少，追问病史，以往均无类似病史及家族史。停用甲硝唑后白细胞、血小板在短时间内回升，且未再出现下降。可以认为白细胞、血小板减少系甲硝唑所致。
8.房室传导阻滞：1例患者有青霉素、磺胺、解热镇痛药、羟氨苄青霉素等过敏史，此次发病，未用其他药物，单用甲硝唑过程中出现心律失常，血清乳酸脱氢酶增高，考虑可能为药物所致的变应性心肌损伤，停用甲硝唑，给予支持及对症治疗，心电图及血清乳酸脱氢酶恢复正常。
9.疱疹性皮炎：目前甲硝唑广泛应用于口腔、腹腔等部位厌氧菌感染及其他疾病的治疗，但用药期间应引起足够的注意，尤其是过敏体质的患者，会引起严重的药疹，包括大疱性表皮松解型药疹。若用药后出现药疹时应及时停药，以避免重型药疹的发展。
10.孕妇早产：阴道炎常常会导致孕妇早产，因此，孕妇阴道炎必须得到有效治疗。有些医生习惯用甲硝唑给怀孕妇女使用，以治疗阴道炎降低早产危险。实际上，服用这种药物会使孕妇早产的危险加倍。专家认为，在一些病情严重的情况下，可以使用甲硝唑予以治疗，但不应将其作为一种预防早产的药物推荐给孕妇。
11.精神症状：服用甲硝唑后有人会引发精神障碍，一般连服4～5日，或静滴甲硝唑1克/日后至第4日出现兴奋乱语、视物不清、躁动不安、头痛失眠，一般停药后，症状即可消失。也有人出现严重变态反应伴精神障碍，如意识不清、恐怖狂想、狂躁欲奔、小便失禁，停药后次日，再对症治疗即可恢复，患者病愈后对发作过程无记忆。个别患者在静脉滴注时即出现神志不清、目光呆滞、烦躁不安，一旦肌注安定无效时，需立即停药，以免发生意外。